La qualité microbiologique des eaux usées avant et après traitement et la qualité microbiologique des fruits irrigués par ces eaux après traitement ont été étudié en quantifiant les indicateurs de pollution fécale et recherchant les germes à intérêt sanitaire. Les résultats ont montré que les germes pathogènes peuvent se transmettre et survivre au niveau des fruits irrigués par les eaux usées traitées. Salmonella enterica serovar Typhimurium est l'une des bactéries pathogènes identifiées dans les eaux usées issues du traitement secondaire. Des expériences ont été munies afin de tester l'effet de différentes souches de cette bactérie sur l'intestin du rat. Elles ont prouvé que ce germe cause des pertes d'eau et d'électrolytes au niveau du jéjunum, de l'iléon et du côlon du rat.
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