Dans le Discours sur l'anatomie du cerveau publié à Paris en 1669, Sténon évalue les connaissances les plus débattues de son temps. Il y critique notamment les systèmes de Descartes et de Willis, qui instrumentalisent l'anatomie au profit de spéculations sur le «siège de l'âme». Cet ouvrage n'a jamais bénéficié en France d'édition commentée, ni d'étude prenant en compte à la fois sa dimension scientifique et ses enjeux philosophiques.
L'histoire de sa réception montre pourtant comment le texte a d'abord été utilisé de manière polémique contre le cartésianisme, puis lu comme un manifeste permettant de conduire rigoureusement l'analyse de «la machine du corps humain».
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